Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms