Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF5Q13568 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms