Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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C1orf61Q13536 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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C1orf61Q13536 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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C1orf61Q13536 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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C1orf61Q13536 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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C1orf61Q13536 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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C1orf61Q13536 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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C1orf61Q13536 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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C1orf61Q13536 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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C1orf61Q13536 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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C1orf61Q13536 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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