Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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