Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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