Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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TOP3AQ13472 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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TOP3AQ13472 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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