Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 TMEM138-202ENST00000381787 1205 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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MKRN4PQ13434 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC023194.3-201ENST00000522679 277 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
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