Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XRCC4Q13426 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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