Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms