Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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