Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK3Q13003 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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