Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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