Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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