Protein–RNA interactions for Protein: Q0GE19

SLC10A7, Sodium/bile acid cotransporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A7Q0GE19 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms