Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms