Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms