Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms