Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms