Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms