Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVS71-1P61550 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms