Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.6 ms