Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAP25P60880 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms