Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIRAP54198 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIRAP54198 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIRAP54198 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIRAP54198 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIRAP54198 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIRAP54198 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIRAP54198 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HIRAP54198 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIRAP54198 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIRAP54198 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIRAP54198 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIRAP54198 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIRAP54198 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIRAP54198 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIRAP54198 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIRAP54198 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIRAP54198 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms