Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMSP52788 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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