Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR5P51681 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR5P51681 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR5P51681 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR5P51681 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR5P51681 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR5P51681 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR5P51681 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR5P51681 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR5P51681 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR5P51681 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR5P51681 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR5P51681 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR5P51681 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR5P51681 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR5P51681 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms