Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK8P49336 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK8P49336 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK8P49336 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK8P49336 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK8P49336 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK8P49336 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK8P49336 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK8P49336 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK8P49336 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK8P49336 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK8P49336 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms