Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT2P45379 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT2P45379 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.9 ms