Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms