Protein–RNA interactions for Protein: P37023

ACVRL1, Serine/threonine-protein kinase receptor R3, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVRL1P37023 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVRL1P37023 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVRL1P37023 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms