Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHI3L1P36222 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHI3L1P36222 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHI3L1P36222 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHI3L1P36222 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHI3L1P36222 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHI3L1P36222 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHI3L1P36222 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHI3L1P36222 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHI3L1P36222 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms