Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
COPB2P35606 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPB2P35606 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPB2P35606 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms