Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms