Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms