Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms