Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms