Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP1P29466 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms