Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5AP29375 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms