Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA3P29320 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms