Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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