Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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HOXD10P28358 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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HOXD10P28358 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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HOXD10P28358 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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HOXD10P28358 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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HOXD10P28358 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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HOXD10P28358 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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HOXD10P28358 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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HOXD10P28358 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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HOXD10P28358 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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HOXD10P28358 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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