Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PLNP26678 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms