Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms