Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ME2P23368 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ME2P23368 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms