Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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