Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms