Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLA1P09884 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
POLA1P09884 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLA1P09884 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLA1P09884 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLA1P09884 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLA1P09884 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLA1P09884 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLA1P09884 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
POLA1P09884 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLA1P09884 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLA1P09884 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLA1P09884 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLA1P09884 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms