Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRCP08575 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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