Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms