Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EGFRP00533 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGFRP00533 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGFRP00533 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGFRP00533 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGFRP00533 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGFRP00533 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGFRP00533 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGFRP00533 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGFRP00533 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGFRP00533 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGFRP00533 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGFRP00533 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms