Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms